L’analyse phylogénétique permet l’identification de foyer d’hyper endémie en temps réel.
Near real-time monitoring of HIV transmission hotspots from routine HIV genotyping: an implementation case study.
Rédigé par : Dr Guillaume Gras
En Colombie Britannique (Canada), depuis 2013, l’analyse phylogénétique des données des génotypes lors des découvertes est réalisée en routine. Cette analyse permet d’identifier en temps réel des clusters de transmission.
Depuis 1999, plus de 32000 génotypes pour 8800 patients ont été identifiés. Le délai moyen entre la réalisation d’un génotype et l’inclusion dans la base de données est de ...
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