Évaluation de différentes méthodes d’analyse des séquences pour la détection des variants résistants minoritaires du VIH-1.
Evaluation of different analysis pipelines for the detection of HIV-1 minority resistant variants.
Rédigé par : Dr Morand-Joubert Laurence
La détection fiable des variants minoritaires de résistance (VRM) entre 1 et 20% nécessite une analyse bioinformatique avec des algorithmes spécifiques. Le but de cette étude était d'analyser les données de séquençage à haut débit (UDS) en comparant 3 logiciels d'analyse.
Des séquences de transcriptase inverse (RT), de protéase et d'intégrase de patients sous antirétroviraux ont été obtenues e...
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